Żołnierz piechoty morskiej zapada na poważną chorobę po ataku bronią genetyczną. Członkowie zespołu poszukują sprawcy zamachu. Rosa choruje na grypę. W tym czasie Deeks ma problemy z zachowaniem równowagi pomiędzy pracą a życiem rodzinnym.
Do drużyny dociera tajemnicza wiadomość. Fatima i Rountree są zmuszeni do podjęcia współpracy. W tym czasie Killbride planuje odwiedziny u syna. Callen prosi Sama, by został on jego drużbą.
Członkowie zespołu podejmują się rozwiązania sprawy z 2003 roku. Dotyczy ona zaginięcia podoficera marynarki wojennej. Kilbride i jego syn Alex pracują na odbudowaniem swojej relacji.
Ekipa prowadzi sprawę rezerwisty marynarki wojennej. Mężczyznę pchnięto nożem, a należące do niego laboratorium, w którym przetrzymywał pestycydy i owady, zostało ograbione. Kilbride proponuje Samowi tymczasowe objęcie stanowiska kierownika operacyjnego.
Czworo ludzi, w tym oficer CIA, ginie w biały dzień od postrzałów. Członkowie ekipy uważają, że napaść może mieć związek z programem DRONA. Podczas spotkania Pembrook zdradza Callenowi więcej szczegółów z jego przeszłości.
Znika agent ATF. Agencja zwraca się z prośbą o pomoc do członków ekipy NCIS. Muszą oni przeprowadzić dochodzenie w sprawie skradzionej broni wojskowej i odnaleźć zaginionego pracownika. Callen i Anna w dalszym ciągu planują swój ślub.
Callen i Anna podejmują decyzję dotyczącą ślubu. W czasie przyjęcia pan młody otrzymuje list od Hetty. Znajdują się w nim gratulacje oraz prośba, aby wraz z Samem spotkali się z nią w Maroku.
Agenci NCIS to spin-off słynnego serialu „Agenci NCIS". Chris O'Donnell wciela się w rolę Callena, agenta specjalizującego się w tajnych misjach. Raper i aktor LL Cool J gra agenta specjalnego, Sama Hannę, byłego członka Navy SEALs i eksperta do spraw Bliskiego Wschodu. Wraz ze wspierającą ich ekipą agenci pracują nad tajemniczymi i nieraz wstrząsającymi zagadkami kryminalnymi. Po premierze serial był chwalony za świetne przedstawienie Los Angeles, intrygujące postacie i inteligentny scenariusz wyróżniający go spośród innych seriali policyjnych.