Przestępcy przebierają się za agentów policji, by okraść opancerzone auta z fabryki, która produkuje tego typu pojazdy. Agenci rozpoczynają trudne dochodzenie.
Szeryf federalny oraz jeden z najważniejszych świadków przestępstwa zostają napadnięci, a następnie zamordowani. Maggie i OA rozpoczynają śledztwo w tej sprawie. Poszukują świadka, który ma doprowadzić ich do zabójcy.
Nielegalny handlarz bronią, a jednocześnie policyjny informator zostaje zamordowany. OA wyglądem przypomina będącego ofiarą zabójstwa mężczyznę, dlatego postanawia go udawać, w celu zdobycia informacji dotyczących przestępstwa.
Pewien mężczyzna usłyszał wyrok dożywocia. Wkrótce po tym wydarzeniu sędzina oraz jej córka zostają zamordowane. Maggie i OA zastanawiają się, czy te dwie sprawy są ze sobą powiązane, czy jest to tylko zbieg okoliczności.
Dochodzi do morderstwa działacza o skrajnie prawicowych poglądach. Zdarzenie miało miejsce tuż po wygłoszeniu przez ofiarę kontrowersyjnego wykładu na wyższej uczelni w Nowym Jorku.
Pewna para odpowiada za serię ataków z bronią w ręku. Maggie i OA prowadzą poszukiwania sprawców, którzy przyczynili się m.in. do śmierci oficera policji. Zginął on, nie będąc na służbie.
Reporter śledczy zostaje zamordowany. Detektywi wpadają na trop opisanych przez dziennikarza spraw z przeszłości. Maggie coraz częściej myśli o swoim zmarłym mężu, który również był reporterem.
Seryjny zamachowiec tym razem obiera sobie za cel elity Wall Street. Agenci Maggie i OA zaczynają śledztwo mające na celu doprowadzenie ich do przestępcy. Ten nie zamierza jednak łatwo odpuścić i za wszelką cenę chce rozprawić się z finansistami.
Zostaje porwana pochodząca z zamożnej rodziny Elizabeth Chase. Jej ojciec jest właścicielem medialnego imperium i naraził się wielu ludziom. Wydaje się, że sprawca chce zdobyć rozgłos, ale Maggie i OA odkrywają jego prawdziwe zamiary.
Diana wraz z Maggie próbują zrobić wszystko co w ich mocy, aby ofiary seryjnego mordercy zaznały sprawiedliwości. Burmistrz w tym czasie stara się wymusić na detektywach, by koszty dochodzeń były niższe.
Oficer zajmujący się deportacjami zabija żonę i dwoje dzieci, doprowadza do eksplozji i ucieka. OA i Maggie prowadzą zakrojone na szeroką skalę poszukiwania zbiega, który popełnia kolejne zbrodnie.
Życie traci amerykański dyplomata. Detektywi rozpoczynają śledztwo w tej sprawie. Jubal i OA starają się pomóc swoim znajomym w pokonaniu ich wewnętrznych demonów.
Na operację serca do USA przyjeżdża jeden z najważniejszych egipskich polityków. OA zostaje wyznaczony do jego ochrony. Funkcjonariusz stara się, aby jego osobista opinia na temat polityka nie wpłynęła negatywnie na jakość wykonywanej pracy.
Rozpoczyna się śledztwo po śmierci szanowanego i wielokrotnie odznaczonego oficera FBI. Detektywi odkrywają, że agent prowadził podwójne życie. Maggie zaczyna zastanawiać się ile nowych informacji o zmarłym policjancie powinna ujawnić jego żonie.
Maggie ma kłopoty, gdyż kobieta, która była jedynym świadkiem w procesie o morderstwo jej męża, zostaje porwana. Dochodzenie prowadzi do odkrycia siatki kryminalnych powiązań. Dana ryzykuje swoją karierę, pozwalając Maggie wziąć udział w śledztwie.
Serial FBI opowiada historię agentów pracujących w nowojorskim oddziale amerykańskiego Federalnego Biura Śledczego. Elitarna jednostka, złożona z najlepszych specjalistów, wykorzystuje wszystkie swoje umiejętności, intelekt i najnowsze technologie w najważniejszych sprawach kryminalnych. Wszystko po to, żeby chronić kraj i mieszkańców jednego z największych miast świata. Agentka Specjalna, Maggie Bell, pochodzi z rodziny, która od pokoleń związana jest ze służbą w policji i za wszelką cenę chce bronić ofiar przestępstw, które prowadzi. Jej partner, Agent Specjalny Omar Adom "OA" Zidan, ukończył West Point i pracował wcześniej jako agent DEA. Ich szefową jest Isobel Castille, agentka z wieloletnim doświadczeniem. Zespołowi pomagają również Jubal Valentine, która świetnie motywuje kolegów, była policjantka, Tiffany Wallace, oraz jej partner Stuart Scola, były finansista z Wall Street. Cały zespół pracuje nad sprawami z zakresu terroryzmu, przestępczości zorganizowanej oraz szpiegostwa.