Samobójstwo popełnia były oficer marynarki, a na jaw wychodzą kompromitujące fakty z jego życia. Agenci NCIS udowadniają, że oficer nie targnął się na swoje życie. Sądzą też, że nie był winien zarzucanych czynów.
Agentka Lee, która okazała się szpiegiem w NCIS, ma teraz pomóc w schwytaniu przestępców odpowiedzialnych za ujawnianie tajnych akt rządowych. Dzięki niej agenci mają dotrzeć do zamieszanego w sprawę Teda Bankstona.
Zespół bada okoliczności śmierci oficera, który zginął w wypadku samochodowym. Trop prowadzi Gibbsa i ekipę NCIS w podziemny świat brutalnych walk. Śledczy muszą ustalić, czy potajemne zajęcie ofiary w jakiś sposób przyczyniło się do jego śmierci.
Zbliżają się święta Bożego Narodzenia. Agent Gibbs i zespół NCIS zmuszeni są do wytężonej pracy. Ich śledztwo komplikuje się, gdy wychodzi na jaw, że główny podejrzany nie żyje.
W więzieniu dla kobiet w Maryland wybuchają zamieszki spowodowane zamordowaniem strażnika. Agent Timothy McGee jest przetrzymywany w zakładzie karnym jako zakładnik. Zespół NCIS musi wyjaśnić okoliczności zbrodni.
Zespół prowadzi śledztwo w sprawie morderstwa oficera marynarki. Tymczasem pochodząca z Afganistanu kobieta rani nożem Ducky'ego. Podczas śledztwa wychodzą na jaw tajemnice z przeszłości mężczyzny.
Zespół usiłuje rozwiązać zagadkę morderstwa pewnego sierżanta. Sprawca dokonał mordu w bardzo nietypowy sposób. Agenci analizują życie osobiste zamordowanego. Podejrzewają, że tam tkwi klucz do zagadki.
Gibbs musi zmierzyć się z traumatycznymi wspomnieniami z przeszłości podczas prowadzenia śledztwa w sprawie bestialskiego zabójstwa żołnierza z piechoty morskiej.
Zamordowano świadka, którego zeznania doprowadziły przed laty do skazania przestępcy. Gibbs i DiNozzo zamieniają się rolami podczas śledztwa w tej sprawie, gdyż trop prowadzi do jednego z dochodzeń Tony'ego sprzed trzech lat.