Zostaje zamordowany René 'La Grenouille' Benoit poszukiwany przez agentów handlarz bronią. Główną podejrzaną o dokonanie zabójstwa staje się Jenny Shepard. Dyrektorka NCIS zostaje zawieszona w obowiązkach służbowych.
Ziva udziela Gibbsowi tajemniczego ostrzeżenia. Agent zaczyna rozważać, dlaczego spędziła ona tyle lat w ukryciu, po tym jak upozorowała swoją śmierć. Zastanawia się również nad tym, co sprawiło, że postanowiła wrócić.
Znaleziono zwłoki. Ciało przymocowano do podwozia ciężarówki, która jechała do bazy marynarki wojennej. Ekipa pracuje nad odnalezieniem podejrzanego. Przemierzają trasę pokonaną przez auto.
Zespół detektywów wiążę tajemniczą zbrodnię na Cmentarzu Narodowym w Arlington z atakami na bezdomnych weteranów. Vance domaga się, aby McGee, Bishop i Torres posprzątali pokój z dowodami. To zadanie ma stanowić dla nich karę za ukrywanie informacji.
Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie kapral piechoty morskiej. W domu żołnierki została znaleziona broń palna, która stanowi dowód w jednej ze spraw. Kobieta nie jest jednak w żaden sposób związana z ofiarą, a w czasie gdy dokonano zabójstwa spała.
Detektywi z agencji NCIS otrzymują wyjątkowo delikatne zadanie. Jeden z oficerów grozi popełnieniem samobójstwa, a oni mają powstrzymać desperata. Podczas akcji okazuje się, że zespół musi rozpocząć inne dochodzenie.
Po powrocie z więzienia syn podoficera zostaje znaleziony martwy na własnej imprezie powitalnej. Wszystkie zebrane w toku śledztwa dowody wskazują na winę wieloletniego przyjaciela Kassie, Dantego.
Członkowie zespołu rozpoczynają dochodzenie w sprawie morderstwa żołnierza piechoty morskiej. Podczas śledztwa detektywi odkrywają w motelu w stanie Virginia system kamer szpiegowskich zamontowanych w celu prowadzenia transmisji na żywo.
Członkowie zespołu prowadzą śledztwo dotyczące morderstwa muzyka z elitarnej orkiestry marynarki wojennej. Gibbs niespodziewanie musi wziąć wolne w pracy. Przekazuje dowodzenie McGee.
Agenci prowadzą dochodzenie w sprawie zastrzelonego w parku admirała Kennetha Kirklanda i jego kierowcy. Wygląda na to, że to nie admirał był celem morderców...
Pod opiekę agentów NCIS trafia dziewięciolatek. Ojciec chłopca jest poszukiwany listem gończym w związku z morderstwem. Agenci poznają jego mroczną przeszłość.
Zespół Gibbsa zatrzymuje oficera piechoty. Agenci mają z nim problem, ponieważ mężczyzna jest weteranem wojny w Iraku, ale myśli, że nadal znajduje się na froncie. Okazuje się, że padł ofiarą medycznych doświadczeń.
Zostaje zamordowany oficer piechoty, który był wyznawcą islamu. Jego ciało znaleziono niedaleko meczetu. Agenci FBI podejrzewają, że w tej okolicy terroryści werbują nowych członków. Ducky celowo wstrzymuje śledztwo.
Ekipa DiNozzo z pomocą Gibbsa ściga złodzieja nowoczesnego radaru. Na ich oczach dochodzi do morderstwa. Detektywi są przesłuchiwani w tej sprawie w charakterze świadków. Ducky zaczyna się dziwnie zachowywać.
Pies, który zaatakował swego właściciela ma być uśpiony. Abby postanawia udowodnić, że zwierzę było niewinne. Wie, że ryzykuje swoją karierę, ale nikt nie potrafi jej powstrzymać.
Zostaje zamordowany René 'La Grenouille' Benoit poszukiwany przez agentów handlarz bronią. Główną podejrzaną o dokonanie zabójstwa staje się Jenny Shepard. Dyrektorka NCIS zostaje zawieszona w obowiązkach służbowych.
Nikki Jardine i Tony DiNozzo jadą do Iraku. Upozorowano tam zamach terrorystyczny mający ukryć starannie zaplanowane morderstwo. Wdowa po ofierze ujawnia, że miał tam przeprowadzić jakąś handlową transakcję.
Członkowie zespołu prowadzą pościg za niebezpiecznym handlarzem bronią. Bishop zaskakuje drużynę swoimi nowymi umiejętnościami. Gibbs i Marcie zaczynają podejrzewać, że poszukiwany przez nich morderca, wie o ich działaniach.
Mallard ma dokonać sekcji zwłok zamarzniętego funkcjonariusza marines, Liama O'Neilla. Tuż przed autopsją odkrywa, że mężczyzna żyje. Detektywi muszą ustalić, jak doszło do tego, że został uznany za zmarłego.