Mężczyzna ginie w wyniku eksplozji bomby, która została mu doręczona do domu w paczce. Członkowie ekipy podejmują działania, by ująć sprawcę i przejąć kolejną niebezpieczną przesyłkę.
Dochodzi do eksplozji bomby w samochodzie kandydatki na prezydenta. OA i Maggie rozpoczynają dochodzenie. Muszą dotrzeć do sprawcy zamachu, zanim zaatakuje ponownie.
Po strzelaninie w nocnym klubie okazuje się, że agencja prawdopodobnie zlekceważyła wcześniejsze groźby ze strony lokalnej grupy zwolenników białej supremacji.
Kochający mąż oraz ojciec dwójki dzieci zostaje bez swojej wiedzy wmieszany w nielegalne interesy. Następnie pada ofiarą uprowadzenia. Agenci rozpoczynają dochodzenie w sprawie.
Dochodzi do zabójstwa inwestora z Wall Street. Podczas dochodzenia agenci wpadają na trop tajnej giełdy, która wykorzystuje nowatorskie metody do pozyskiwania informacji. U OA pojawiają się wątpliwości, dotyczące jego nowego związku z Moną.
Prezes zarządu nowo powstałej spółki technologicznej zostaje zamordowany. Agenci dociekają, kto zyskuje najwięcej na jego śmierci. OA przeżywa dylemat moralny związany z niesieniem pomocy krewnemu.
Członkowie ekipy prowadzą dochodzenie w sprawie wypadku, w którym zginął fotograf. Gdy odkrywają okoliczności tragedii, okazuje się, że pozornie prosta sprawa jest o wiele bardziej skomplikowana.
Dochodzi do kłótni nauczyciela, Patricka Millera, z jego uczniem. Po awanturze mężczyzna znika. Członkowie zespołu sprawdzają każdą osobę, która mogła być z nim skonfliktowana.
Wychodzi na jaw, że dawna ofiara porwania jest związana z serią morderstw. Jedną z poszkodowanych jest córka detektywa z Nowego Jorku. Kristen zaczyna wątpić, czy nadaje się na agentkę.
Dochodzi do zabójstwa biznesmena oskarżanego o molestowanie. Członkowie ekipy podejrzewają, że sprawcą morderstwa może być jedna z osób, które zarzucały mu napastowanie.
Podczas dochodzenia związanego ze sprawą napadu na bank ekipa odkrywa skrytkę, której zawartość może stanowić zagrożenie dla bezpieczeństwa narodowego. Kristen chce powrócić do pracy w terenie.
Dochodzi do porwania syna emerytowanego agenta. Członkowie zespołu rozpoczynają dochodzenie. Muszą ustalić, czy nie jest to akt zemsty. Na jaw wychodzą informacje dotyczące przeszłości Isobel. W związku z tym kobieta podejmuje trudną decyzję.
Odnaleziono zwłoki prokuratora i prostytutki. Członkowie ekipy próbują ustalić, co łączy zamordowanych. Okazuje się, że Jubal miał powiązania z jedną z ofiar. Śledztwo staje się jego sprawą osobistą.
Serial FBI opowiada historię agentów pracujących w nowojorskim oddziale amerykańskiego Federalnego Biura Śledczego. Elitarna jednostka, złożona z najlepszych specjalistów, wykorzystuje wszystkie swoje umiejętności, intelekt i najnowsze technologie w najważniejszych sprawach kryminalnych. Wszystko po to, żeby chronić kraj i mieszkańców jednego z największych miast świata. Agentka Specjalna, Maggie Bell, pochodzi z rodziny, która od pokoleń związana jest ze służbą w policji i za wszelką cenę chce bronić ofiar przestępstw, które prowadzi. Jej partner, Agent Specjalny Omar Adom "OA" Zidan, ukończył West Point i pracował wcześniej jako agent DEA. Ich szefową jest Isobel Castille, agentka z wieloletnim doświadczeniem. Zespołowi pomagają również Jubal Valentine, która świetnie motywuje kolegów, była policjantka, Tiffany Wallace, oraz jej partner Stuart Scola, były finansista z Wall Street. Cały zespół pracuje nad sprawami z zakresu terroryzmu, przestępczości zorganizowanej oraz szpiegostwa.