Członkowie zespołu prowadzą pościg za niebezpiecznym handlarzem bronią. Bishop zaskakuje drużynę swoimi nowymi umiejętnościami. Gibbs i Marcie zaczynają podejrzewać, że poszukiwany przez nich morderca, wie o ich działaniach.
Ziva udziela Gibbsowi tajemniczego ostrzeżenia. Agent zaczyna rozważać, dlaczego spędziła ona tyle lat w ukryciu, po tym jak upozorowała swoją śmierć. Zastanawia się również nad tym, co sprawiło, że postanowiła wrócić.
Znaleziono zwłoki. Ciało przymocowano do podwozia ciężarówki, która jechała do bazy marynarki wojennej. Ekipa pracuje nad odnalezieniem podejrzanego. Przemierzają trasę pokonaną przez auto.
Agenci Gibbsa otrzymują informację o odnalezieniu samochodu ze śladami krwi. Auto należy do zaginionej porucznik marynarki wojennej. Detektywi w jej mieszkaniu odkrywają kartotekę mężczyzn. Kobieta poszukiwała partnera.
Zespół detektywów wiążę tajemniczą zbrodnię na Cmentarzu Narodowym w Arlington z atakami na bezdomnych weteranów. Vance domaga się, aby McGee, Bishop i Torres posprzątali pokój z dowodami. To zadanie ma stanowić dla nich karę za ukrywanie informacji.
Ginie oficer, który brał udział w tajnej akcji. Agenci NCIS przypadkowo zatrzymują rosyjskiego szpiega. Przeszukują jego samochód i znajdują w nim broń, z której zabito oficera. Śledztwo coraz bardziej się komplikuje.
Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie kapral piechoty morskiej. W domu żołnierki została znaleziona broń palna, która stanowi dowód w jednej ze spraw. Kobieta nie jest jednak w żaden sposób związana z ofiarą, a w czasie gdy dokonano zabójstwa spała.
Zostaje odnalezione ciało kaprala. Był poszukiwany, ponieważ nie zgłosił się na służbę w Iraku. Agenci NCIS odkrywają, że został pochowany, a potem ekshumowany. Okazuje się, że kapral miał dwie narzeczone.
Po powrocie z więzienia syn podoficera zostaje znaleziony martwy na własnej imprezie powitalnej. Wszystkie zebrane w toku śledztwa dowody wskazują na winę wieloletniego przyjaciela Kassie, Dantego.
Członkowie zespołu rozpoczynają dochodzenie w sprawie morderstwa żołnierza piechoty morskiej. Podczas śledztwa detektywi odkrywają w motelu w stanie Virginia system kamer szpiegowskich zamontowanych w celu prowadzenia transmisji na żywo.
Członkowie zespołu prowadzą śledztwo dotyczące morderstwa muzyka z elitarnej orkiestry marynarki wojennej. Gibbs niespodziewanie musi wziąć wolne w pracy. Przekazuje dowodzenie McGee.
Nazwisko Sloane pojawia się podczas śledztwa w Afganistanie. Sprawa dotyczy porzuconego autobusu, w którym znaleziono zwłoki kierowcy. Gibbs i Jacqueline rozpoczynają poszukiwania grupy dziewcząt.
Zespół prowadzi dochodzenie w sprawie zabójstwa podoficera. Przebieg całego zdarzenia był transmitowany na żywo na modnej aplikacji dla graczy. Sąsiadka Gibbsa prosi go, by zajął się jej 9-letnim synem. Kobieta musi nagle wyjechać z miasta.
W przyczepie jednego z food trucków zostają znalezione zamarznięte zwłoki mężczyzny. Podczas dochodzenia członkowie drużyny zapoznają się z branżą pełną bezpardonowej rywalizacji.
Członkowie ekipy zostają wezwani do nietypowego incydentu. Po przybyciu na miejsce odkrywają, że sprawa dotyczy wypadnięcia rakiety z ciężarówki. Zespół wpada na trop seryjnych morderstw psów.
Gibbs zostaje zmuszony do zmierzenia się z konsekwencjami swojej decyzji. Agent udziela Zivie pomocy w realizacji ostatniego zadania, które musi ona wykonać, by wrócić do drużyny.
Vance zleca McGee, Torresowi i Bishopowi nadzór nad przestrzeganiem bezpieczeństwa covidowego na międzynarodowym szczycie. Podczas pracy ekipa odkrywa trop powiązany ze sprawą morderstwa innego agenta NCIS.
Agenci NCIS odkrywają, że pracującego nad tajnym projektem porucznika Marynarki zabił robot 'Otto'. Niewiele brakuje, by przez tę maszynę zginęła również Abby...
W podmiejskim motelu został znaleziony martwy wysokiej rangi oficer wywiadu marynarki. Na miejscu zbrodni Gibbs dowiaduje się, że lokalne władze już od trzech dni prowadzą dochodzenie w tej sprawie.
Poszukiwany na całym świecie niebezpieczny terrorysta zdobywa najnowocześniejszą broń chemiczną i grozi atakiem na miasta w USA. Agenci NCIS rozpoczynają współpracę z wojskowymi detektywami.
Donald "Ducky" Mallard musi wziąć udział w tajnej misji, która ma powstrzymać proceder sprzedawania broni produkowanej według najnowszej wojskowej technologii. Gibbs organizuje spotkanie Ducky'ego z potencjalnym kupcem.
W niezamieszkanym budynku znaleziono ciało młodego marine. Początkowo agenci NCIS i policjanci sądzą, że zmarł w wyniku nadmiernego spożycia alkoholu. Wkrótce zostaje odnaleziony ślad, który wnosi wiele do śledztwa.
Porucznik marynarki zostaje napromieniowany radioaktywnie. Gibbs dochodzi do wniosku, że ktoś tu dokonał zamachu, żeby sabotować jego działania. Aby rozwiązać tę sprawę, agenci muszą zaprosić do współpracy ekspertów.
Na cmentarzu wojskowym dochodzi do wybuchu. Zostają odnalezione ludzkie szczątki. Gibbs i jego ludzie szukają seryjnego zabójcy. Identyfikują szczątki pięciu osób i próbują ustalić, czy ofiary były ze sobą powiązane.
Mallard ma dokonać sekcji zwłok zamarzniętego funkcjonariusza marines, Liama O'Neilla. Tuż przed autopsją odkrywa, że mężczyzna żyje. Detektywi muszą ustalić, jak doszło do tego, że został uznany za zmarłego.