Ekipa prowadzi dochodzenie w sprawie kapral piechoty morskiej. W domu żołnierki została znaleziona broń palna, która stanowi dowód w jednej ze spraw. Kobieta nie jest jednak w żaden sposób związana z ofiarą, a w czasie gdy dokonano zabójstwa spała.
Zostaje zamordowany kapitan marynarki wojennej Zespół Gibbsa bada okoliczności zbrodni. Ofiara miała dostęp do tajnych informacji wojskowych. Abby potrafi odczytać kod, ale ktoś kasuje wszystkie pliki z dysku.
Ducky przeprowadza sekcję zwłok mężczyzny. Zespół Gibbsa ustala, że zmarły to Marvin, informator FBI. Próbował on zdemaskować Kamala, który zmieniał tożsamość przestępców, żeby ukryć ich kryminalną przeszłość.
Detektywi z agencji NCIS otrzymują wyjątkowo delikatne zadanie. Jeden z oficerów grozi popełnieniem samobójstwa, a oni mają powstrzymać desperata. Podczas akcji okazuje się, że zespół musi rozpocząć inne dochodzenie.
Na morzu ulega wypadkowi statek badawczy. Agenci NCIS badają okoliczności tragedii. Okazuje się, że komandor Satoshi Takada nie żyje, a reszta załogi uciekła z okrętu w popłochu. Ducky robi sekcję zwłok zmarłego komandora.
Gibbs angażuje się w sprawę związaną z jego przeszłością. Detektyw znów rozmyśla o swojej zmarłej tragicznie przed laty córce, gdy zaczyna pomagać jej dawnej przyjaciółce, która znajduje się w niebezpieczeństwie.
Kobieta, która została pochowana żywa, wydostaje się z grobu. Nie pamięta, kim jest, ale wie, że na statku marynarki wojennej ma wkrótce wybuchnąć bomba. Agenci rozpoczynają śledztwo i znajdują martwego Richtera.
Członkowie NCIS REACT giną w eksplozji. Jedynie agentka specjalna Jessica Knight wychodzi cało z katastrofy. Kobieta dołącza do zespołu, by dowiedzieć się, co się stało.
Dyrektor NCIS Jenny Shepard szuka handlarza bronią. Spotyka się w tej sprawie z tajnym informatorem. Mężczyzna ginie, nie zdążywszy wyjawić wiadomości. Gibbs i jego koledzy próbują ustalić, co wiedziała ofiara.