Ceniony ekspert od broni biologicznej zostaje zamordowany w strzeżonej placówce na Hawajach. Śledczy łączą siły z elitarnym oddziałem, by wspólnie schwytać zabójcę. Przy okazji odkrywają jeszcze większe zagrożenie.
Ktoś morduje podoficera marynarki. Jane i pozostali członkowie zespołu prowadzą śledztwo, starając się jednocześnie ochronić jego dziewczynę i towarzyszkę broni.
Ofiarą morderstwa pada antykapitalistyczny działacz. Śledczy trafiają w sam środek wojny o kawałek ziemi toczonej między ekologicznymi aktywistami a miliarderem z branży technologicznej.
Zespół NCIS wznawia dochodzenie w sprawie znalezionych kości z okresu II wojny światowej. w 80. rocznicę zbombardowania Pearl Harbor. Śledczy odkrywają, że należą one do ocalonego z ataku stulatka.
Ekipa NCIS zajmuje się sprawą kontenera transportowego wypełnionego bronią. Tennant zastanawia się nad aresztowaniem ojca kolegi jej syna. Dla chłopaka będzie to oznaczać kolejną przeprowadzkę.
Zostają skradzione dowody, które miały doprowadzić do ujęcia narkotykowego bossa. Lucy decyduje się na tajną misję podczas nielegalnego turnieju pokera. Zostaje wystawiona na trudną próbę.
Ekipa wyjaśnia sprawę śmierci technika marynarki wojennej Josepha Chana. Ostatnią osobą, która go widziała, była mentorka i przyjaciółka Jane, Maggie Shaw. Kobieta została uprowadzona.
Po aresztowaniu Maggie Shaw Jane trafia na przesłuchanie. Pozostali członkowie zespołu prowadzą śledztwo w sprawie żołnierzy, którzy wskutek emisji fal ultradźwiękowych doznali uszkodzenia słuchu.
Jesse i jego córka Grace udają się w rejs. Ich statek niespodziewanie przejmują piraci, którzy biorą pasażerów na zakładników i atakują Jessego. Zespół próbuje jak najszybciej znaleźć łódź i uratować Grace.
Kai udaje kucharza w restauracji, żeby zebrać informacje na temat powiązanego z lokalem bossa mafii. Jane odkrywa, że Alex dostał propozycję stypendium sportowego od szkoły. Chłopak skrzętnie ukrywał tę informację przed swoją rodziną.
Domagający się okupu hakerzy wywołują awarię tamy. Ernie i specjaliści do komputerów próbują odnaleźć sprawcę. Muszą to zrobić, zanim dostawy prądu i wody na wyspę zostaną odcięte.
Agenci NCIS Nick Torres i Jessica Knight wyruszają na Hawaje. Podążają śladem kluczowego świadka w jednej z poprzednich spraw, który zjawił się na wyspie i posiada ważne dla śledztwa dowody.
Ekipa Jane bada sprawę wraku okrętu przewożącego egzotyczne zwierzęta. Muszą one zostać odnalezione, bo są zagrożeniem dla lokalnej fauny. Alex doznaje kontuzji, która zaprzepaszcza szanse na karierę.
Marynarz okazuje się być zamieszany w zabójstwo. Zespół musi pracować nad jego sprawą mimo dnia wolnego. Z kolei Lucy dowiaduje się, że Whistler odrzuciła propozycję awansu do Waszyngtonu, ponieważ chciała być na Hawajach.
Na wyspę wraca kapitan Milius. Jego celem jest przeprowadzenie sekretnej misji wymiany więźniów. Wraz z Jane, jako swoją osobistą ochroną, udaje się na Filipiny. Tam ma dojść do planowanej operacji.
Tennant i jej zespół wciąż współpracują z kapitanem Miliusem w związku z wymianą więźniów między Stanami Zjednoczonymi a krajami Europy wschodniej. Whistler nie traci nadziei na odzyskanie Lucy. Słucha rady Erniego i decyduje się na wielki gest.
Amerykański serial kryminalny przedstawiający losy specjalnych agentów z jednostki NCIS, którzy zajmują się rozwiązywaniem trudnych zagadek kryminalnych.