Zespół wyjaśnia okoliczności włamania do siedziby admirała. Pewien senior twierdzi, że jest weteranem bitwy o Pearl Harbor. Pragnie, by po śmierci jego szczątki złożono na okręcie USS Arizona.
Sześcioletni chłopiec powiadamia agentów, że jego ojciec został porwany. Zaginiony mężczyzna posiadał kody umożliwiające dostęp do tajnych danych, które zostały skradzione. Uprowadzenie może być mistyfikacją...
Ginie małżeństwo płatnych zabójców. Tony i Ziva muszą znaleźć osobę, która była ich zleceniodawcą. Tymczasem Gibbs odkrywa, że nie tylko jego zespół interesuje się tą sprawą.
Detektywi prowadzą dochodzenie w sprawie śmierci kobiety, której ciało znaleziono w bazie Quantico. Według ekspertyzy głównym podejrzanym jest Tony. Dla Abby udowodnienie niewinności Tony'ego staje się sprawą osobistą.
Zespół NCIS urządza obławę na żołnierzy piechoty morskiej, którzy prowadzą sklep z częściami pochodzącymi z kradzionych samochodów. Na tylnym siedzeniu jednego z aut agenci znajdują odciętą głowę.
Zespół Gibbsa bada okoliczności eksplozji karetki wiozącej ciało żołnierza, który zginął w wypadku samochodowym. DNA osoby znalezionej w ambulansie nie jest zgodne z kodem genetycznym zmarłego.
Grupa nastolatków znajduje identyfikatory żołnierzy piechoty morskiej. Gibbs przypuszcza, że wpadli na trop seryjnego mordercy, który w przeszłości zabijał ofiary w parku.
W bazie Quantico pewien licealista bierze swoich kolegów na zakładników. Grozi zdetonowaniem przymocowanej do ciała bomby. Gibbs pertraktuje z nastolatkiem. Podejrzewa, że chłopak nie działa sam.
W zamarzniętym jeziorze zostają odnalezione ciała czterech osób. Jedna z ofiar zostaje zidentyfikowana jako zaginiony żołnierz piechoty morskiej. Pozostali byli członkami miejscowego gangu.
Podejrzana o szpiegostwo kobieta popełnia samobójstwo. Agenci znajdują dowody, że w chwili śmierci nie była sama. Rozpoczynają poszukiwania mordercy w nadziei na rozwiązanie afery szpiegowskiej.
Dowód przeniesiony z miejsca zbrodni powoduje skażenie laboratorium. Stan Abby jest bardzo ciężki. Teraz agenci zdają sobie sprawę, że to ona była celem przestępcy. Poznają zaskakujące fakty z przeszłości koleżanki.
Ziva jest w szoku. Umiera podejrzany, nad którym sprawowała pieczę. Jego brat nic nie wie o całym zdarzeniu. Porywa dyrektor Shepard w nadziei, że wtedy agenci zgodzą się z nim pertraktować.
Gibbs zostaje ranny w zamachu i powoli wraca do zdrowia. Ma czas na rozmyślania. Musi sobie teraz poradzić ze wspomnieniami, które od dawna próbował wymazać z pamięci.
Po zamachu Gibbs wciąż ma luki w pamięci. W powrocie do zdrowia pomaga mu wizyta dawnego szefa. Tymczasem agenci dowiadują się, że terroryści planują spektakularny atak na Marynarkę Wojenną Stanów Zjednoczonych oraz że Gibbs zna szczegóły ich planu.